Если с давлением на ТНВД все в норме, то тогда смотри в сторону нипеля на трубке подачи топлива. У вас эта приблуда стоит для откачки воздуха из топливной системы при замене топливного фильтра. Так вот, нипель от его старости и западания клапана просто может подтравливать воздух при заглушеном двигателе( тем более у вас соляра имеет хорошую плюсовую температуру и когда остывает через этот нипель подсасывает воздух), И вот тогда происходят данного рода казусы. Ну вроде мелочь, а доставляет массу неприятностей. Надо просто поменять нипель на новый и прокачать через него немного соляры (ну чтобы попавший воздух удалить) и должно все заработать в штатном режиме.